我が国で養殖利用されている魚介類を対象として、ゲノム情報の整備、選抜育種に用いるDNAマーカーの開発、ならびに表現型に関与する遺伝子の探索を行っています。また、民間企業との共同研究を通じて、研究室で得られた成果の社会実装にも取り組んでいます。これまでに、DNAマーカーを利用したマダイの成長形質に関する選抜育種技術の開発や、ウイルス耐性系統の作出、各種遺伝病の原因遺伝子の同定などを進めてきました。
さらに、保全ゲノミクスの観点から、養殖場から逸出した養殖マダイと天然個体との交雑が天然集団に及ぼす影響の評価や、適応進化の視点に基づく解析にも取り組んでいます。
